尿道内刺痛、流脓，要明确刺痛、流脓的原因。若是细菌感染造成的刺痛、流脓，需要抗细菌治疗，可以取脓液做细菌培养加药敏，针对性的使用对这种细菌敏感的抗菌药物，最多见的药物是喹诺酮类的药物，如氧氟沙星、左氧氟沙星，或者头孢类药物，如头孢硫脒、头孢克洛、头孢他啶等药物。若是支原体、衣原体感染造成的尿道流脓，需要使用针对支原体、衣原体的药物，最多见的药物是红霉素类的药物，如红霉素、罗红霉素、克拉霉素等药物。若是性病，最多见的是淋球菌感染造成刺痛、流脓，需要使用针对淋球菌的药物，淋球菌感染流的脓液一般呈黄色或者黄绿色。淋球菌感染可以使用青霉素类的药物，如阿莫西林、哌拉西林，也可以使用头孢类的药物，如头孢克洛、头孢硫脒等药物。