肛周脓肿和肛瘘的区别主要在于是否存在外口，肛周脓肿指的是直肠肛管周围软组织或其周围间隙发生的急性化脓性感染，并形成脓肿，如果脓肿破溃或切开引流后常常会形成肛瘘。肛周脓肿是肛管直肠周围炎症的急性期表现，而肛瘘四期慢性期表现，肛瘘一般是由内口、外口、瘘管三部分组成。内口多为原发性感染病灶，绝大部分位于肛管齿状线处的肛窦部位，外口多是继发性，在肛门周围皮肤上，可为一个或多个，瘘管指连接内外口之间的纤维性管道。