睾丸疼痛的病因主要包括：1、附睾炎：附睾炎是睾丸疼痛较为多见的病因，病人可能表现出发热、疼痛侧阴囊红肿、附睾以及睾丸体积增大等表现；2、慢性盆腔疼痛综合征：盆腔充血或循环不畅会造成病人表现出精索痛、睾丸痛、下腰痛以及会阴部痛，主要和病人的精神、情绪等相关；3、附睾结核：附睾结核也可能引发睾丸疼痛，需使用抗结核药物进行治疗。