大便太臭是由于大便中吲哚、粪臭素、硫化氢、氨气成分过多造成，这些都是蛋白质被肠道细菌分解形成的物质，也就是进食高蛋白时大便就会变臭。大便发臭也可以由肠道疾病造成，多见的有消化道出血，主要是硫化氢产生过多。肠道有恶性肿瘤时因为癌组织的糜烂、出血，再加上细菌的分解发酵作用，大便也会很臭。肠道有细菌感染时肠黏膜受到细菌毒素的破坏，大便也会排出脱落坏死的黏膜细胞，也会使大便变臭。