引发肛瘘的原因主要有五大类：一、年龄因素，小儿在生长发育过程中，由于小儿皮肤娇嫩、肛门括约肌松弛、直肠及其黏膜外翻等原因，加之局部长时间受粪便等污染，容易表现出局部感染，形成脓肿，破溃之后表现出肛瘘。二、感染，长时间大便干结造成肛裂，反复发作表现出陈旧性肛裂，形成感染，容易引发皮下瘘。三、外伤，肛周因受外伤造成直肠肛管和体外形成通道，愈合不理想的情况可能表现出肛瘘。四、肛周脓肿，肛周表现出急性化脓感染形成脓肿，治疗不及时的情况下，脓肿会自行溃破引流，因此形成肛瘘。五、手术后遗症，一些会阴部手术如产后会阴缝合，前列腺尿道手术、直肠肛管癌等手术都有可能形成肛瘘。