肩膀有骨头突出主要有以下原因：一、正常骨性突，正常人体也可以看到的肩部骨头突出，例如肩峰、锁骨等部位突出，尤其比较瘦的病人，会更加明显，属于正常现象；二、陈旧性损伤，如果肩膀骨头受到骨折，在其恢复后，可能由于恢复不彻底或骨折短，有骨质增生，可能造成肩膀的骨头比较突出；三、先天性骨畸形，也可能表现出先天性的高肩胛骨；四、脊柱侧弯，病人有脊柱侧弯可能表现出肩膀骨头突出；五、肩部占位疾病，可能会造成表现出骨肿瘤。