如果尿道口有小疙瘩，发生这种情况的原因一般有以下这几种可能的原因：1、首先要考虑的是尖锐湿疣病，这种疣体一般分布在尿道口、龟头冠状沟等多个部位，表现为乳头样或菜花样的突起，表面不光滑，触碰时伴随明显的出血，并且可以伴随异常分泌物等，多经过不洁的性接触而传播，属于性病的一种，需要进行局部组织活检，来确诊是否为尖锐湿疣；2、尿道口囊肿，表现为表面光滑的结节样突起，呈囊泡样改变，没有分泌物，没有疼痛的症状。如囊肿较小，一般不影响排尿，但如果体积较大，则可能阻挡尿道口造成病人的排尿困难。所以这种情况建议需要到医院，由专业医生检查后，明确具体的原因，根据不同病因予以不同的处理。