怀孕3个月流褐色分泌物可能是流产先兆，还可能是妇科炎症造成的，最好及时去医院检查。如果有流产先兆，还容易造成腹痛等，应及时B超检查，检查胎儿发育情况，如果胎儿发育正常，需要在医生指导下服用保胎药物，同时补充维生素E，建议适当的卧床休息，预防流产。如果宫缩频繁，可以在医生指导下用硫酸镁等药物，可以抑制宫缩。如果有妇科炎症，可能是阴道炎，应及时取分泌物检查，在医生指导下使用消炎的栓剂治疗，如果孕期有妇科炎症治疗不及时，容易造成宫内感染，孕期不要乱用药物，避免使用药物不当，容易影响胎儿发育。