龟头刺痛、流脓可能的原因：1、化脓性包皮龟头炎，多由细菌感染造成，感染后可表现出龟头局部红肿、糜烂伴脓性分泌物，此时触碰龟头疼痛较明显，也可伴随尿频、尿急、排尿疼痛，尿道口可分泌脓性分泌物。建议全休，口服或静脉输注抗生素治疗，等待龟头炎治愈后，如果合并有包皮过长，建议行包皮环切手术。2、淋球菌性尿道炎，淋球菌性感染后可表现出尿频、尿急、排尿疼痛，伴尿道外口流出黄色的脓性分泌物，可污染龟头，局部形成小的溃烂，也可伴少量的分泌物。这种情况建议留取分泌物作细菌培养检查和细菌涂片检查，如果发现淋球菌，建议静脉输注抗生素治疗。