男性膀胱部位隐隐作痛，可能的原因：一、患有慢性的膀胱炎，可以表现出膀胱区隐隐作痛。同时可能伴随尿频、尿急、排尿不适等症状。需要进行尿液常规检查、尿培养检查，进一步确诊。二、膀胱结石，也可以导致膀胱区隐隐作痛，还可以伴随排尿时表现出血尿，或者表现出排尿中断的现象。需要进行膀胱区的B超检查，进行确诊。三、男性前列腺增生、前列腺炎等，都可以表现出膀胱区隐约疼痛。同时多伴随会阴区胀痛不适，或伴随尿无力、尿分叉，或尿液滴沥不尽等症状。需要进行前列腺液检查，或前列腺B超检查，证实是否存在相关的疾病。