肛门疼痛的原因大概有以下5个分类：1、肛周感染。2、肛管的退行性病变。3、因为肛周手术造成的疼痛。4、心理因素造成的肛周疼痛。5、其他原因造成的肛门疼痛。肛周感染多见的有结直肠炎、肛管炎、肛隐窝炎、肛周炎以及女性的盆腔炎、宫颈炎、阴道炎或盆腔积液、淤血和男性的前列腺炎，退行性病变大致有直肠黏膜的松弛、女性的直肠前突、巨结肠和会阴下降还有肛管肌肉的松弛、功能丧失或者肌肉痉挛、骶直肌分离、乙状结肠疝等。手术肛周的多见疾病手术造成的疼痛，女性的妇科手术后造成的肛周疼痛，男性的泌尿系手术后造成的疼痛。当然目前随着社会生活节奏的加快，心理因素也是不可或缺的。排除了以上4种因素造成的肛周疼痛，其他原因，比如尿道直肠综合征、盆底疝、腰椎间盘突出或者椎管狭窄造成的肛周疼痛。