光动力治疗的缺点，一是在注射完光敏剂后需要避光一个月，不能见太阳；二是由于个体差异，局部会表现出副作用，如食管癌做完治疗后可能会表现出食管、气管瘘，若是距心脏位置较近的肿瘤，可能会影响心脏的心率问题，光动力治疗虽然有一些缺点，但是相比较其他治疗，副作用还是比较低的。