如果肛乳头肥大不及时治疗，它会造成恶变，因此一旦明确应该积极的行手术切除。肛乳头肥大是一种良性的病变，它会造成肛门部不适。病人初期无明显的症状，常有排大便不尽，肛门有异物感和下坠感，严重者还会表现出里急后重。有时肛门内会有烧灼痛、刺痛，排便时因粪便压迫肛隐窝，使肛门部疼痛加重。初期疼痛不剧烈，数分钟内可消失。如果肛门内括约肌痉挛收缩，可使疼痛加剧，短时间内表现出阵发性的刺痛，严重者还会波及臀部及股后部。有时肛乳头肥大，局部感染会形成脓液。排便时脓液分泌物容易造成肛周瘙痒，造成肛门潮湿。急性期还会有排大便困难，粪便中常常带有少量的粘液，有时还会表现出便血。巨大的肛乳头肥大堵塞肛门，还会造成便秘以及粪便变形。