霉菌性阴道炎和滴虫性阴道炎的区别主要表目前以下三大方面。一、病原体的不同。霉菌性阴道炎的病原体主要为外阴假丝酵母菌，滴虫性阴道炎的病原体主要为阴道毛滴虫。二、感染的症状不一样。霉菌性阴道炎可表现出豆渣样白带，滴虫性阴道炎常为灰白色泡沫状白带。三、治疗的药物不同。霉菌性阴道炎一般选用抗真菌药物，如克霉唑、咪康唑等。滴虫性阴道炎一般选用甲硝唑药物。