睡醒后有一只眼睛疼，可能跟睡觉没关系，可能会发生麦粒肿，只是经过睡觉之后发现的比较明显。如果眼睛疼，红，发生局部肿物，可能是这只眼的睑腺发生炎症。需要到医院来开抗细菌以及抗炎的眼膏，局部点在疼的眼睛上。如果有一只眼睛是涨疼，还应当到医院检测下眼压。总之有个眼睛疼，如果不缓解，应当到医院及时检查。