阴茎根部的皮肤有小肉粒，首先有可能是皮肤软纤维瘤，也有可能是病毒感染的疣。1、皮肤软纤维瘤的发生主要和遗传，内分泌以及肥胖有一定的关系。一般表现为皮色的小肉粒、不痛不痒，没有明显的增大、增多的趋势，一般在很长一段时间内都没有太多的变化。2、病毒疣，是一种人乳头瘤病毒感染皮肤所造成的，会表现出明显的增多，增大的趋势。病毒疣的治疗主要是经过激光和冷冻进行去除，对于反复发作的，还要考虑可以使用光动力进行治疗。具体需要面诊之后才能决定是哪一种病。