上尿路感染的原因很多，性生活活跃期及绝经后的女性，容易获得上尿路感染。因为女性尿道明显短于男性，细菌更容易逆行感染。此外长时间留置导尿管或支架管，长时间间歇性膀胱导尿，膀胱残余尿并且长时间大于一百毫升者，长时间憋尿者也容易造成上尿路感染。此外，患有梗阻性尿路疾病，比如膀胱出口梗阻，神经源性膀胱，结石，肿瘤等等。存在膀胱，输尿管反流病人，尿流改道术后，化疗或者放疗后，尿路上皮损伤的病人，患有肾功能不全，移植肾，糖尿病，免疫缺陷疾病等等，都容易造成上尿路感染。