做完根管治疗后牙疼的原因，具体如下：一、扩大针或拔髓针穿出根尖孔，损伤根尖周组织。二、根管错将感染坏死物质推出根尖孔后，造成根尖周感染。三、放置木馏油或甲醛、甲酚等消毒药物，刺激根尖周组织，产生胀痛。四、牙冠表面的充填体存在咬合高点，造成合干扰，造成牙周膜间隙增宽。五、氢氧化钙糊剂或牙胶尖超出根尖孔后，造成根尖周组织的炎性反应。六、髓室底或根管侧壁发生穿孔时，细菌再次感染，引发疼痛。七、使用压缩空气吹干根管或应用过氧化氢溶液荡洗根管时，发生根管外的气肿。