沙眼衣原体阳性要看其感染的部位：若是眼部，那就是沙眼，是一种慢性传染性眼病，但是现阶段随着生活水平的提高，卫生常识的普及，医疗条件的改善，沙眼的发病率大大降低，现阶段，沙眼在我国已基本上控制。沙眼主要经过接触传播，母婴传播，昆虫传播等。沙眼在眼部的初始表现急性结膜炎，多发生于儿童及青少年，急性期，1到2个月后进入慢性期。沙眼，如果不及时治疗可能会表现出并发症，多见的由睑内翻倒睫，上睑下垂，睑球粘连，结膜干燥症，角膜混浊等。沙眼的治疗一般是给予抗感染治疗，如果表现出并发症可给予手术治疗。此外，沙眼衣原体还会感染生殖器等，那可能会表现出生殖器的一些病变。