治疗肛乳头肥大，一般可以经过药物甚至手术治疗。药物治疗主要是经过中药保留灌肠，也可以进行中药熏洗。常用的药物有五倍子汤、苦参汤或者止痛如神汤进行肛周熏洗，起到清热、利湿、消肿的作用。平时应该养成良好的饮食习惯，多喝蜂蜜或者香油，促进大便的顺利排出，减轻粪便对肛窦、肛腺的刺激。如果局部存在细菌感染，还应该应用抗菌药物进行治疗。如果肛乳头肥大，长时间脱出肛门，有时不能还纳，造成嵌顿、水肿，触之伴疼痛，这种还需要积极的行手术切除。如果肛乳头肥大伴随脓肿的形成，还应该积极的行脓肿切开引流。