三个月宝宝发烧以后吃什么药取决于造成发烧的疾病是什么，因为三个月的宝宝造成发烧的疾病很多，可以是病毒感染，可以是细菌感染，也可以是支原体或者真菌感染，不同的感染源所使用药物会不同。对于发热来说，三个月的宝宝建议尽量使用物理降温。像孩子在体温超过38*5℃或者不到38*5℃的时候，都可以给孩子适当的用温水擦拭身体或者给孩子直接洗温水澡都有降温的作用。可以适当的使用物理的降温，像冰贴或者退热贴，对于三个月宝宝的发热也会有帮助。如果体温实在38*5℃以上，始终不能控制下，可以适当的考虑给孩子服用对乙酰氨基酚幼儿剂型，根据孩子的体重给药，一般来说，服药半小时到一小时左右，孩子的体温也会有所缓解。但只是针对发热本身的处理，如果造成孩子的发热病因不能去除，发热一定是反复的。对于三个月的宝宝来说，相对抵抗力比较差，而且临床症状会相对不典型，如果表现出发热应当马上到医院就诊，明确造成发热的病因，然后针对性的给予孩子治疗，才能真正的改善孩子的发热状态。