自闭症疗育师证书是由多个国家和地区的专业机构颁发的，包括美国、加拿大、澳大利亚、英国、新西兰等，自闭症疗育师证书主要由以下几个机构颁发：

1、中国特殊教育协会：中国特殊教育协会(China Special Education Association,简称CSEA)是一个全国性的非营利性社会组织，致力于推动特殊教育的发展，该协会设有专门的自闭症研究与培训中心，负责组织和开展自闭症教师的专业培训和认证工作，通过参加由中国特殊教育协会组织的自闭症教师培训和考试，学员可以获得中国特殊教育协会颁发的自闭症疗育师证书。

2、中国残疾人联合会：中国残疾人联合会(China Disabled Persons' Federation,简称CDPF)是中国残疾人事业的领导机构，负责组织和协调全国范围内的残疾人工作，该联合会设有专门的残疾人教育培训中心，负责组织和开展残疾人教师的培训和认证工作，通过参加由中国残疾人联合会组织的自闭症教师培训和考试，学员可以获得中国残疾人联合会颁发的自闭症疗育师证书。

3、其他国家和地区的专业机构：除了上述两个机构外，还有一些国家和地区的专业机构也颁发自闭症疗育师证书，如美国的Autism Speaks、国际自闭症研究会(International Autism Research Society,简称IARS)等，这些机构通常会与中国的特殊教育协会或残疾人联合会合作，共同开展培训和认证工作，学员在完成相应的培训和考试后，可以获得这些机构颁发的自闭症疗育师证书。

自闭症疗育师证书的颁发机构有很多，主要包括中国特殊教育协会、中国残疾人联合会以及其他国家和地区的专业机构，学员可以根据自己的需求和实际情况选择合适的培训机构和颁发机构，以便更好地提升自己的专业素养和能力。