肛门失禁的病人症状较轻时，可采取提肛锻炼的方式，加强肛门括约肌功能，来缓解症状。非手术治疗正常比较适合情况不是很严重的肛门失禁病人，正常来说可采取促排便的方式进行治疗，使病人可以正常排便，防止腹泻及便秘的发生。病人还应防止食用刺激性的食物，应多食用粗纤维的食物。如果以上方式无法达到治疗的目的，则可采取电刺激的方式进行治疗。若症状较严重，可采取手术治疗的方法。主要方法是肛门成形手术，肛门括约肌替代手术等。手术治疗一般多针对先天性疾病所造成的肛门失禁病人。