早孕期褐色分泌物的多见原因有以下几种：1、生化妊娠，精子和卵子已经结合了但是没有游到宫腔内着床，或者是游到了但是没有成功着床称为隐性流产，一般发生在孕5周内的流产，病人正常没有其它症状，因此经常被忽略；2、胚胎发育异常会自然流产，早孕期流产或胎停育中有50%-60%是因为染色体异常流产，如果发现褐色分泌物，应当在除外宫颈等生殖器异常后，顺其自然，不要随意保胎，不然到后期还会表现出更大的问题；3、宫颈异常，最多见的是宫颈糜烂，性生活后次日表现出褐色分泌物，应当考虑宫颈糜烂，宫颈息肉也会造成出血，而且会持续不断，早孕期褐色分泌物先去妇产科看宫颈；4、双子宫或残角子宫畸形，正常子宫妊娠后，异常的子宫内膜会随着增厚而表现出少量出血，早孕期怀孕出血，超声检查不可缺少；5、子宫内膜脱落，有些女性怀孕后卵巢分泌的孕激素水平比较低，造成一小部分子宫内膜继续脱落，这部分女性怀孕后依然会来月经，只是月经量比正常少很多，直到妊娠3个月后胎盘形成了，女性体内的雌孕激素维持在比较高的水平，这时子宫内膜不再脱落，月经也就不再来了；6、宫外孕，受精卵在子宫腔外着床发育的异常妊娠过程，宫外孕常有不规则阴道出血，色暗红、量少、淋漓不尽，一般不超过月经量，宫外孕的危害极大，受精卵不但不能发育成正常胎儿，如果不能及时发现宫外孕治疗有可能危及生命。