上厕所时大便出血并伴随疼痛时，需据大便出血的颜色、量以及疼痛的具体感觉来进行综合判断。若大便出血的颜色偏深且伴随恶臭味，则需及时到医院进行肠镜检查，以排除占位性疾病的可能。若血液和大便分离，则大多为痔疮或肛裂所造成的，此时需及时到医院就诊，进行综合性的治疗。