胎停育的病因十分复杂，有遗传因素、血栓前状态、免疫因素、内分泌因素、解剖结构因素，感染因素等。胎停育比较多见的原因，有染色体异常，在胎停育中约50%~60%的妊娠物有染色体异常，而且部分的染色体异常随女性年龄增长而发生率增加，胚胎停育发生的时间越早，胚胎染色体异常的概率就会越高。除了染色体异常，女性的身体素质也会有影响，例如存在器质性疾病或者免疫问题，对于多次流产的备孕女性，应到医院做全身的系统性免疫检查，尽可能的减少身体因素所造成的胎停育。