感染幽门螺旋杆菌以后肌体很难以自发清除，往往造成终身感染。虽然人群感染幽门螺旋杆菌相当普遍，但是感染后的结局却大相径庭。所有幽门螺旋杆菌感染的病人最终会发展为胃炎，但是仅仅有少部分会发展为消化性溃疡，极少部分发展为胃癌或者胃黏膜相关性淋巴瘤。现阶段认为造成这种结局巨大差异是由于幽门螺旋杆菌、感染者和环境因素三者相互作用的结果。在根除幽门螺旋杆菌方面，经过规律的根除方案仍有部分幽门螺旋杆菌感染者因为依从性和细菌耐药性的原因难以一次或者多次根除。专家提示感染幽门螺旋杆菌后，机体很难自发清除往往造成终身感染。就算经过规律的幽门螺旋杆菌根除治疗，部分感染者因为依从性和细菌耐药性的原因，也难以根除。