变形杆菌食物中毒的治疗，主要是以对症治疗为主。对于胃肠型的，应当要纠正电解质失衡、解痉、抗感染治疗为主。过敏型的以抗过敏治疗为主，胃肠型的要充分的补液，以及解菌治疗。呕吐和腹泻明显同时伴随脱水、休克、或者酸中毒的病人时，应当要及时的补充液体，纠正电解质失衡。可以使用氨基糖类抗生素，以及喹诺酮类抗生素治疗。过敏型的应当给予抗组织胺治疗，可以选用扑尔敏以及异丙嗪，或者葡萄糖酸钙进行静脉注射。