排大便时肛门疼痛，最多见的原因就是肛裂。肛裂的疼痛主要是周期性的疼痛，用力排便时肛管裂开，呈刀割样的疼痛。排便数分钟疼痛减轻或者消失，一般称为疼痛的间歇期。排便后约半小时表现出反射性的内括约肌痉挛收缩，造成剧烈的疼痛，往往持续数小时，多数能逐渐缓解，这种周期性的疼痛主要是肛裂的特征性的症状。有时排大便时肛门疼痛还有可能是痔疮造成，如果痔核反复脱出肛门，如果不能及时的还纳。局部淤血，形成血栓，形成嵌顿痔，也会造成肛门周围疼痛。