1*凡有肛门直肠疾病症状者，如便血、坠胀、脱出、疼痛等。2*直肠下段病变的活组织检查。3*不明原因的腹泻和便血。肛门镜检查可以检测评估痔的程度，有无肛瘘内口、息肉、肛乳头病变等。也可以用来诊断直肠癌。如果做完肛门指诊后发现以下情况时，应该防止进行肛门镜检查：1*肛管、直肠狭窄者。2*肛管、直肠急性期感染或局部有疼痛性病灶，如肛门直肠周围脓肿、肛裂等。3*怀疑直肠穿孔或有全身器质性疾病、严重精神疾病不能耐受者。4*妇女月经期。