阴茎变黑，有的是人体生长发育中表现出的一种正常的生理变化，一般男性性成熟以后，在雄激素的作用下表现出色素沉着变黑，就像腋下皮肤、乳头肌、腹股沟、大腿根部那样表现出色素沉着变黑一样，这不是一种疾病的表现。当然，如果有在阴茎局部表现出了皮肤疾病或长时间摩擦，也会导致一定的色素沉着，但是正常情况下，随着疾病的痊愈，这种黑色素会随着时间的延长为慢慢退去。若是生理状况下阴茎颜色变黑深是一种生理的变化，不是疾病。