怀孕50天有褐色分泌物，如果在这个之前发现是子宫内怀孕，这种情况大多数考虑是先兆流产，有可能和女性劳累以后再加上受精卵本身在子宫内着床的不是很牢固，就会表现出这样的现象。但是还有一种可能性，是胚胎停止发育。如果因为各种原因造成受精卵本身异常，这种情况下，胚胎在子宫里面停止发育也会表现出这样的现象。