正常情况下对于消化不良要积极的寻找病因，若是消化道系统的疾病，需要积极治疗原发疾病，同时对症处理消化不良。若是全身性疾病，如糖尿病甲亢、甲减，一些药物造成的如酒精、非甾体类抗炎药，关键的是要注意戒除一些诱发因素，积极治疗原发病。对于功能性的消化不良主要就是对症处理，促进胃肠蠕动，应用一些促进胃肠蠕动的药物，如吗丁啉，莫沙必利，和一些抗酸药物如泮托拉唑、奥美拉唑、雷贝拉唑等。如果有明显的腹痛，还可以适当的应用一些解痉止疼类药物。