尿道内刺痛流脓，可能的疾病：1、淋球菌性尿道炎，也成为淋病，它是一种性传播疾病，典型的表现为尿道内刺痛，伴尿道口流出黄色的脓性分泌物。建议留取黄色脓性分泌物作革兰氏阴性双球菌的涂片检查，或者做淋球菌培养检查。如果找到淋球菌则可以确诊，需要进行抗链球菌的治疗。2、非淋病性尿道炎，常多见于支原体、衣原体感染。也可表现出尿道内瘙痒、疼痛，伴随尿道口流出黄色稀薄样的分泌物，或者白色稀薄样的分泌物。建议留取分泌物做支原体、衣原体培养。如果确诊，就得要给予药物对症处理。3、急性化脓性的细菌感染性的尿道炎，也可表现出尿道内的刺痛伴脓性分泌物流出。建议留取分泌物做细菌培养，找到致病菌以后进行抗感染治疗。