大脑炎为感染性乙脑病毒导致的，主要是经过蚊虫叮咬传播。病毒进入人体后，当被感染者免疫力弱，可侵入中枢神经系统，造成脑实质的病变。它的病因主要是带有乙脑病毒的蚊虫叮咬后，病毒进入体内，随后进入血液循环，形成病毒血症。感染病毒后是否发病及造成疾病的严重程度，主要取决于感染病毒的数量及毒力，而更重要的也取决于病人的人体免疫力。当被感染者机体免疫力强时，只形成短暂的病毒血症，病毒很快可被清除，不侵入中枢神经系统，临床上表现为隐性的感染或轻型病例，最终可获得终身免疫力。如果被感染者免疫力低下，而感染病毒大量及毒力强，则病毒可侵犯中枢神经系统，造成脑实质病变。