经过肛门指检可以明确是否存在肛管直肠病变，直肠指诊时一般采用侧卧位、膝胸位或截石位。检查者四指戴涂润滑剂的指套，首先从肛周皮肤开始，注意肛周有无硬结、肿物，有无触痛波动感。如果皮下触及绳索状硬条，还应该触之其走向和深度。肛门指诊时，应该发现肛周的皮肤是否硬结肿块等。经过指诊还应该明确是否存在肛门失禁，是否表现出肛门括约肌松弛。如果经过困难注意明确是否存在肛管直肠狭窄，记录狭窄的部位，区分是环状狭窄还是带状狭窄，明确直肠内是否表现出肿块，是否合并菜花样的溃疡。