怀孕45天有褐色分泌物，这种情况的表现出一般是不正常的，首先可以考虑先兆流产的可能，可以到医院做B超、抽血检查孕酮值和HCG值，如果孕酮值和HCG值并不在理想范围之内，需要做保胎处理，可以在医生的指导下口服黄体酮或者注射黄体酮针，并注意多卧床休息；此外，如果在怀孕45天表现出褐色分泌物，同时出血呈点滴状，下腹部一侧有撕裂痛，推测为宫外孕导致的输卵管破裂出血，需要尽快到医院做B超检查，查看孕囊的位置，排除宫外孕的情况。建议女性在怀孕后，积极做好孕酮、HCG和B超检查，密切关注胎儿的生长发育情况。