肛门有黏液，最多见的还是肛周感染性疾病，主要是肛窦炎或者直肠炎，反复的发作会造成有明显的分泌物经肛门流出，患者还会有局部的疼痛，伴随发热。此外，长期的感染会造成局部有瘘口或者肛瘘的形成，需要及时的进行手术切开引流，进行瘘管切除。也有一种情况是肛周的痔疮主要是内痔，由于形成了曲张的静脉团，甚至形成了栓子，影响了静脉血液回流，而造成局部的黏膜有明显的渗出，肛门有黏液样的物质流出。这种情况下，可以选择应用肛门栓剂来减轻症状，或者在黏膜下注射硬化剂，让痔核逐渐萎缩，严重的情况下，也可以选择手术。