胃肠科主要是胃肠道疾病的诊治和治疗，还有检查。其中最多见的、最主要的检查，是胃镜和结肠镜检查。胃镜主要是检查胃部疾病，包括胃炎、消化性溃疡、胃癌，还有一部分胃石症。胃石症比较少见，多见于进食柿子和山楂。有关肠道的检查，主要就是结肠镜检查，可以观察有无息肉、溃疡性结肠炎、结肠癌等疾病。胃、肠镜检查属于有创检查，但是这些检查是最主要的检查方式。还有一些检查主要是包括呼气试验，是检查幽门螺旋杆菌的主要方式。幽门螺旋杆菌是胃炎、胃溃疡、胃癌的致病菌，因此目前呼气试验是检查幽门螺旋杆菌的金标准。