女性甲减多见的原因是自身免疫性甲状腺炎，其中最多见的是桥本氏甲状腺炎，桥本氏甲状腺炎是因为机体自身产生了异常的抗体，如甲状腺过氧化物酶抗体、甲状腺球蛋白抗体，这些抗体会产生细胞毒性作用，损伤甲状腺组织细胞，因此造成甲状腺合成和分泌的甲状腺激素减少，产生甲减。其它多见的还有产后甲状腺炎，也是和自身免疫因素相关，包括妊娠期免疫耐受、产后免疫反弹等因素，多发生在分娩或流产后一年内，但是这种甲减往往呈一过性，大多数患者可以自行恢复。其它的原因还包括手术或者抗甲状腺的药物所造成的甲减、亚甲炎造成的甲减，比较少见的是垂体或者下丘脑功能异常所造成的甲减。