肠镜和肛门镜最大的区别就是长短不一样。电子肠镜就是电子结肠镜，可以检查整个结肠，长度有1*5m左右，从肛门进入，循行着结肠自然的腔道直接上行，可以探查到回盲瓣，就是大肠和小肠交界的地方，可以退镜检查整个结肠。肛门镜的距离比较短一些，只有8-10cm的长度，主要检查肛门周围的疾病，比如痔疮、下段直肠息肉。肠镜和肛门镜第二个比较大的区别就是检查之前的准备不一样，如果做电子结肠镜，需要病人检查当天早晨服用泻药，清理干净肠道才能做。肛门镜检查做之前准备比较简单，排干净大便就可以做肛门镜的检查。