妇科滴虫病首选甲硝唑治疗。由于滴虫常感染尿道及尿道周围腺体，系统使用甲硝唑疗效优于局部用药。甲硝唑治疗期间防止性行为，及治疗后48小时内应防止饮酒。由于近年来甲硝唑耐药的病例时有表现出，有报道甲硝唑耐药或不能耐受的病人，可以使用替硝唑代替治疗。不能系统性治疗才考虑局部用药，临床可选择甲硝唑栓剂或片剂，阴道内给药。