临床上多见的抗甲亢的药物包括硫脲类和咪唑类两种。其中硫脲类药物又包含丙硫氧嘧啶和甲基硫氧嘧啶两种。国内常用丙硫氧嘧啶。米唑类药物包含他巴唑和卡比马唑两种，国内主要使用他巴唑。临床上的首选药物是他巴唑，而丙硫氧嘧啶有肝毒性，因此选择的相对少，它主要是用于妊娠的早期，因为它不容易经过胎盘导致畸形。