睡醒后头疼，眼睛疼，有多种原因，多见的有：一、视疲劳，多见于长期使用手机，电脑等电子产品，长期熬夜的人群，建议减少用眼，注意休息。二、眶上神经痛，当眶上神经受到刺激会造成眼眶及其周围组织的疼痛。三、眼部的感染，如果表现出了眼睑，结膜，角膜，虹膜等眼部的感染后，也会造成眼睛及其周围组织的疼痛。四、青光眼，这是要特别注意的，如果眼睛涨痛，伴有有视力下降，甚至恶心，呕吐，头痛等不适，很有可能是急性青光眼的表现。因此表现出了头疼，眼睛疼，建议立即就诊，明确病因针对治疗。