孕妈妈在怀孕三个月的时候，如果表现出小肚子疼得厉害，分析原因有以下几种可能:第一、先兆流产或者是流产。如果由于女性朋友休息不好，情绪不稳定，或者是剧烈的运动，过度劳累，都可能造成女性小肚子疼痛，但是这种疼痛往往是表现出阵发性的疼痛，往往也伴随阴道分泌物的增多，或者是阴道流血。此时，建议女性尽早到医院进行相关的检查，尤其是彩超检查，在医生的检查下明确是否因为先兆流产造成的。若是先兆流产，必要的时候进行保胎治疗。第二、如果由于孕妈妈饮食不洁或者是吃了过于寒凉的食物而造成了胃肠功能紊乱，或者是消化道的感染，那么也可能表现出小肚子疼痛，这种情况往往会伴随女性的恶心，呕吐，腹泻等消化道症状，建议女性经过饮食控制，实在不行也尽早到医院就诊。第三、有可能是由于孕妈妈河边有尿路感染或者是尿路结石而造成的，这种情况往往会伴随尿频，尿急甚至血尿的可能，正常建议多喝水可以缓解，如果有加重的趋势，应尽早到医院就诊。