如果大便不成形，首先考虑是胃肠道疾病造成的。各种细菌或病毒感染造成的继发性肠炎时就容易造成大便不成形甚至表现出腹泻，伴随水样便、粘液样便甚至脓血样便。第二，长时间大便不成形也可能是肠道内的一些致病，例如溃疡性结肠炎，克罗恩病，这些疾病可能和遗传因素有关系，此外也可能和免疫系统功能紊乱有关。第三，大便不成形也可能是肠易激惹综合征造成的，受到情绪刺激时症状会更加严重，有时大便不成形和便秘交替表现出，此外大便不成形也可能是脾虚胃寒造成的消化不良症状。