眼睛上不会长扁平疣，但是可以在眼睑部位表现出扁平疣，由于此部位属于娇嫩的部位，因此说在用药方面应当选择温和无刺激的治疗方案。可以外用重组人干扰素α-2b软膏一日/4次涂抹。或者是口服中药汤剂的方案，主要组成是生薏米仁、红花、赤芍、板蓝根、大青叶、木贼、香附、马齿苋煎水口服200ml/2次。并且可以把剩余的药渣再次煮水，然后用无菌的纱布蘸取药液轻轻地擦拭患处，反复擦拭，直到患处表现出微微发红的情况即可。