孢子菌毛囊炎的治疗，主要是使用抗真菌的药物治疗。孢子菌指的就是一种真菌，感染毛囊以后，会造成毛囊根部被破坏，局部表现出炎症反应，并且造成脱发的症状。需要在病变的部位使用抗真菌的药物，控制局部的真菌性炎症反应。如果病变面积比较局限的话，正常都是在病变的部位涂抹抗真菌的药膏，常用的药膏如硝酸咪康唑软膏，特比萘芬软膏，联苯苄唑乳膏等。如果病变比较扩散，外用药膏治疗的效果不是很好，这种情况下可以经过口服途径给予抗真菌的药物治疗，比如氟康唑，或者伊曲康唑等。