?中毒性巨结肠多自发于爆发性结肠炎，初期或发生在首次发病的几个月内，也可以因低钾及用药不当等或特殊检查而诱发。具体病因有炎症性肠病如溃疡性结肠炎、克罗恩病，感染性肠炎有细菌性，例如伪膜性肠炎、沙门菌感染、致贺菌性肠炎、弯曲菌性肠炎。病毒性例如巨细胞病毒性肠炎、艾滋病病毒感染性肠炎和寄生虫性例如溶组织内阿米巴性肠炎、隐孢子虫性肠炎。其他有卡波西氏肉瘤、多病灶恶性新生血管增殖症，氨甲喋呤治疗造成的萎膜性肠炎、肠扭转、缺血性肠炎、憩室炎、结肠癌性肠梗阻等。发病率尚不确切，有报道溃疡性结肠炎并发中毒性巨结肠的发生率为1*6%到18%，克罗恩病则为1%到7*8%，溃疡性结肠炎和克罗恩病发生中毒性巨结肠的危险性约1%到5%。