怀孕晚期霉菌性阴道炎可以用药治疗。怀孕晚期，如果得了阴道炎也可以用药治疗的，因为如果不治疗的话，霉菌性阴道炎可能会造成胎膜早破，进而有造成早产的可能性。如果经阴道分娩，霉菌性阴道炎也可以感染胎儿，造成胎儿以后发生鹅口疮。所以孕晚期霉菌性阴道炎需要积极的用药治疗，具体的用药需要听从专科医生的建议，比如可以用碱性溶液冲洗会阴部以后阴道内塞抗真菌的药物治疗。